《南京财经大学学报》（原《南京经济学院学报》）（双月刊），原名《粮食经济研究》，是1983年创办的专业性学术刊物；经国家新闻出版署批准，1987年第5期起公开发行；1995年经国家新闻出版署批准更名为《南京经济学院学报》。
该刊自出版以来，在社会上引起了较好的反响。1991年被评为“商业部高校优秀学报”；1992年被《中文核心期刊要目总览》（第一版，北京大学出版社）列为“贸易经济类核心期刊”；1996年被《中文核心期刊要目总览》（第二版）列为“经济类、贸易经济类核心期刊”；1997年起入选清华“学术期刊光盘版”；1999年被中国社会科学院收入《中国人文社会科学核心期刊要览》；2000年获学术期刊光盘版编排规范“优秀执行奖”；2004年12月被再次评为江苏省一级期刊、江苏省优秀期刊，同时入选第二届江苏期刊方阵行列；2006年被再次评为“全国优秀社科学报”；2010年被评为全国高校优秀社科期刊。2020年9月，《南京财经大学学报》“国民经济与产业经济”栏目在2020年江苏期刊·明珠奖优秀栏目（优秀策划）评选活动中被评为优秀栏目。2020年12月，“国民经济与产业经济”栏目在2020年华东地区期刊优秀栏目评选活动中被评为优秀栏目。2021年3月，《南京财经大学学报》被评选为“复印报刊资料重要转载来源期刊（2020年版）”。2021年4月，《南京财经大学学报》入选CSSCI（2021-2022）扩展版来源期刊。2023年，《南京财经大学学报》首次入选中国人文社会科学期刊AMI综合评价核心期刊，继续入选CSSCI（2023-2024）扩展版来源期刊，并在2023年度江苏省高校“精品·优秀·特色”文科期刊评选中获评“优秀期刊”。此外，“国民经济与产业经济”栏目在2023年全国高等学校文科学报研究会第七届高校社科学术期刊质量检查与评估活动中获得特色栏目奖。
《南京财经大学学报》作为反映学校教学科研动态、展示学科建设成果的重要窗口，是与学校办学定位、学科结构特点以及人才培养、专业发展特色相吻合的。《学报》栏目坚持以“围绕学科优势、涵盖专业特长、兼顾教研领域”为指导思想，通过优化整合现有栏目，达到重点突出、包容量大、稳中有活、便于选优的目的。
《南京财经大学学报》设置的主要栏目有国民经济与产业经济、工商管理与公共管理、生态文明与绿色发展、开放经济与对外贸易、数字经济与企业数字化转型等。